Descrizione del progetto
Influenza dell’autofagia sul panorama dell’RNA in condizioni di stress
L’autofagia è un metodo ben noto per riciclare proteine e organelli, ma sembra anche che degradi selettivamente l’RNA per aiutare le cellule a gestire lo stress. Il progetto TranscriptShape, finanziato dal CER, si propone di indagare il funzionamento di questo processo durante l’ipossia, l’esposizione ai raggi UV e lo sviluppo del melanoma. Per farlo userà il sequenziamento e l’immaginografia a singola molecola per individuare i fattori che innescano la degradazione dell’RNA sensibile allo stress. Questa ricerca studia come le cellule mantengano la loro identità modulando il trascrittoma durante i periodi di stress. Inoltre, rivelerà come le cellule tumorali utilizzino queste stesse vie per sopravvivere e adattarsi.
Obiettivo
In the face of environmental stress, autophagy plays a crucial role in stress adaptation through the maintenance of cellular homeostasis. While extensively studied for its ability to degrade proteins, pathogens, and organelles, the potential of autophagy to degrade RNA remains largely unexplored. Recent findings from my team uniquely reveal that specific subsets of RNA are selectively sequestered and degraded by autophagy in a stress-responsive manner. However, the molecular mechanisms driving this process and its biological implications remain unknown. Based on our preliminary results, I hypothesize that autophagy represents a previously unrecognized, highly regulated RNA decay pathway capable of dynamically shaping the transcriptome in response to cellular stress.
Here, I propose a comprehensive approach to investigate autophagy's impact on transcriptome remodeling in response to hypoxia and UV irradiation in cellular models and during melanoma development in mice. To this end, I will integrate state-of-the-art sequencing technologies with subcellular proteomics, high-content screening, advanced biochemistry, and single molecule RNA imaging. In doing so, we will dissect the molecular signals and regulatory factors guiding this previously overlooked RNA decay pathway. Furthermore, we will determine the biological consequences of pathway dysfunction on transcriptome integrity, cellular fitness, and the shaping of cellular identity. Together, this work will provide crucial insights into the mechanisms governing RNA homeostasis during cellular stress. The findings will challenge our current view of autophagy and uncover fundamental new understanding of gene expression regulation in health and disease, with broad implications across the biological sciences.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine proteomica
- scienze mediche e della salute medicina clinica oncologia cancro della pelle melanoma
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA trascrittomi
- scienze mediche e della salute medicina di base fisiologia omeostasi
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2025-COG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
2100 Koebenhavn
Danimarca
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.