Descripción del proyecto
Los plásmidos y la propagación de la resistencia a los antibióticos
Las bacterias han desarrollado sofisticados mecanismos de defensa para combatir a los virus invasores. Los plásmidos —pequeñas moléculas de ADN que transportan y transmiten genes de resistencia a los antibióticos entre bacterias— deben, a su vez, eludir estos sistemas de defensa durante la transferencia. Sin embargo, aún no se conocen con precisión sus procesos tempranos y los mecanismos subyacentes a estas afecciones. El proyecto DEFCONJ, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, se centra en los elementos antidefensivos presentes en los propios plásmidos que se activan durante la transferencia. Los investigadores utilizarán el aprendizaje automático, análisis estructurales y experimentos funcionales para caracterizar estos sistemas y determinar cómo neutralizan de forma conjunta las defensas bacterianas. Los resultados del proyecto ampliarán nuestros conocimientos sobre la propagación de la resistencia a los antibióticos y permitirán diseñar nuevas herramientas para la biología sintética y las aplicaciones clínicas.
Objetivo
The microbial world's genomic arms race spurred a remarkable diversity of defense and anti-defense mechanisms, with CRISPR-Cas and anti-CRISPR systems as prime examples that revolutionized genome editing. Recent years have seen a surge in the discovery of bacterial anti-phage systems and their viral countermeasures, yet little is known about how plasmids—key vectors of antibiotic resistance—overcome host defenses. Our lab recently found that plasmids' leading regions, the first to enter recipient cells, harbor diverse anti-defense systems vital for efficient conjugation. This sets the stage for in-depth studies of plasmid-encoded anti-defenses (PEADs), significantly advancing our understanding of conjugation, with far-reaching implications for clinical and biotechnological applications.
Here, we will explore PEADs through three interconnected aims. In Aim 1 we will develop machine-learning and language model approaches, complemented by structural analyses, to identify and characterize putative PEADs from extensive genomic and metagenomic databases. This will be followed by functional testing in both targeted and high-throughput assays. In Aim 2 we will elucidate PEAD regulation, including early expression from single-stranded promoters and unique mechanisms for transient expression, integrating state-of-the-art computational approaches with in vitro transcription and conjugation efficiency assays. In Aim 3 we will determine how multiple PEADs function in concert to counteract multilayered defenses, informing the design of tailored plasmid-leading regions for efficient DNA transfer to targeted bacteria. DEFCONJ tackles a fundamental question: how do plasmids achieve efficient conjugation despite host defenses? Beyond transforming our understanding of the plasmid-host arms race, this research will advance our comprehension of antimicrobial resistance dissemination, while paving the way for powerful new tools for clinical and synthetic biology applications.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales informática y ciencias de la información base de datos
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología bacteriología
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2025-COG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
69978 Tel Aviv
Israel
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.