Description du projet
Identifier les cibles des microARN
Les microARN (miARN) sont de petites molécules d’ARN qui jouent un rôle essentiel dans la régulation de l’expression génétique. Des preuves de plus en plus nombreuses indiquent leur importance dans les contextes physiologiques et pathologiques, ce qui en fait un axe majeur de la recherche biomédicale. Cependant, la prédiction des cibles génétiques précises des miARN reste un défi informatique majeur. Le projet miRules, financé par l’UE, développera une stratégie bio-informatique avancée pour comprendre le mécanisme par lequel les miARN trouvent leurs cibles. Les chercheurs s’appuieront sur l’outil d’apprentissage profond miRBind et intégreront de nouvelles méthodologies pour améliorer la précision de la prédiction des cibles des miARN. Dans l’ensemble, le projet jettera les bases d’outils d’apprentissage automatique avancés qui soutiendront la recherche fondamentale et translationnelle dans le domaine de la biologie de l’ARN.
Objectif
Micro RNAs (miRNAs) are short regulatory RNA molecules which modulate the levels of RNA and proteins in cells.
Understanding the role of miRNAs in health and disease is a field with high engagement in molecular biology and biomedicine, with over 50 000 scientific articles published in the past 5 years (PubMed search “microrna[MeSH Terms]”).
However, predicting their molecular targets is still a major unsolved challenge, and the state-of-the-art bioinformatic solutions for this task remain far from perfect.
First, the task requires an exceptionally high accuracy and precision, as it can be compared to looking for a few hundred needles in a haystack: a few hundred targets among hundreds of thousands of transcripts. Second, the true mechanism of target binding is still unknown, which necessitates the use of heuristic approaches - ones that seem to work often enough, but are not necessarily related to the way miRNAs actually find their targets.
The aim of this project is to use bioinformatic methods to gain more knowledge about the mechanisms of miRNA-target interactions. We will approach this problem from several angles: 1) Using the deep learning methodology recently developed by the host group (miRBind), which reaches a single nucleotide resolution in its predictions; 2) Analyzing the interactions from an evolutionary perspective; 3) Developing a customized pairwise alignment algorithm combined with a dedicated statistical methodology. The Researcher will benefit from this project by gaining experience in the field of genomics in a multidisciplinary, collaborative environment.
In the future, the results of this project will enable creating knowledge-driven machine learning models for improved prediction of the molecular targets of miRNAs, which will facilitate the fundamental and applied research on the complex biology of these molecules.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.4.1 - Widening participation and spreading excellence
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-WIDERA-2024-TALENTS-02
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
MSD 2080 MSIDA
Malte
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.