Projektbeschreibung
Ziele für microRNA ermitteln
microRNA (miRNA) sind kleine Ribonukleinsäuremoleküle, die eine zentrale Rolle bei der Regulierung der Genexpression übernehmen. Immer mehr Beweise deuten auf ihre Bedeutung sowohl im physiologischen als auch im pathologischen Kontext hin, wodurch sie zu einem wichtigen Schwerpunkt der biomedizinischen Forschung werden. Die Vorhersage der genauen Genziele von miRNA bleibt jedoch eine große rechnerische Herausforderung. Im Rahmen des EU-finanzierten Projekts miRules wird eine fortgeschrittene Bioinformatikstrategie entwickelt, um den Mechanismus zu verstehen, mit dem miRNA ihre Ziele finden. Die Forschenden werden auf dem Deep-Learning-Instrument miRBind aufbauen und neuartige Methoden einbeziehen, um die Genauigkeit der miRNA-Zielvorhersage zu optimieren. Insgesamt wird das Projektteam den Grundstein für fortgeschrittene Maschinenlerninstrumente legen, die sowohl die Grundlagenforschung als auch die translationale Forschung im Bereich der RNA-Biologie unterstützen.
Ziel
Micro RNAs (miRNAs) are short regulatory RNA molecules which modulate the levels of RNA and proteins in cells.
Understanding the role of miRNAs in health and disease is a field with high engagement in molecular biology and biomedicine, with over 50 000 scientific articles published in the past 5 years (PubMed search “microrna[MeSH Terms]”).
However, predicting their molecular targets is still a major unsolved challenge, and the state-of-the-art bioinformatic solutions for this task remain far from perfect.
First, the task requires an exceptionally high accuracy and precision, as it can be compared to looking for a few hundred needles in a haystack: a few hundred targets among hundreds of thousands of transcripts. Second, the true mechanism of target binding is still unknown, which necessitates the use of heuristic approaches - ones that seem to work often enough, but are not necessarily related to the way miRNAs actually find their targets.
The aim of this project is to use bioinformatic methods to gain more knowledge about the mechanisms of miRNA-target interactions. We will approach this problem from several angles: 1) Using the deep learning methodology recently developed by the host group (miRBind), which reaches a single nucleotide resolution in its predictions; 2) Analyzing the interactions from an evolutionary perspective; 3) Developing a customized pairwise alignment algorithm combined with a dedicated statistical methodology. The Researcher will benefit from this project by gaining experience in the field of genomics in a multidisciplinary, collaborative environment.
In the future, the results of this project will enable creating knowledge-driven machine learning models for improved prediction of the molecular targets of miRNAs, which will facilitate the fundamental and applied research on the complex biology of these molecules.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.4.1 - Widening participation and spreading excellence
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-WIDERA-2024-TALENTS-02
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
MSD 2080 MSIDA
Malta
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.