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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Plasmonic nanopore technologies for automatic manipulation and Raman spectroscopic sequencing of single proteins

Descripción del proyecto

Lectura de la secuencia proteica aminoácido por aminoácido

Las proteínas son la clave para comprender las enfermedades y su tratamiento. Si se pudieran secuenciar las proteínas con la misma facilidad que el ADN, transformaríamos la medicina. Con esta idea en mente, el equipo del proyecto RamanProSeq, financiado por el Consejo Europeo de Innovación, pretende crear una plataforma de secuenciación de moléculas individuales sin etiquetas con «hardware» integrado: sensores plasmónicos que amplifican las señales luminosas y permiten la detección de alta resolución de péptidos individuales. El sistema identifica la secuencia de la proteína y mapea las modificaciones que impulsan la biología mecánica y la enfermedad. Este enfoque de alto rendimiento y bajo coste introduce la proteómica en la clínica y la sitúa en pie de igualdad con la genómica y la transcriptómica.

Objetivo

The human proteome offers unprecedented insights into health, diseases and treatment. The current protein detection techniques are either expensive, insensitive, complex or introduce biases. Meanwhile, no amplification methods for proteins exist, which complicates their detection and leads to a serious lag of proteomics behind genomics and transcriptomics, hampering not only mechanistic studies but also clinical applications. The RamanProSeq project aims to develop a label-free optical single-molecule protein sequencing technology capable of reading protein primary sequence at single-amino-acid resolution with high accuracy (>99.9%). The proposed technology will revolutionise the field of proteomics towards personalized medicine and early diagnosis of diseases. The project will be based on the partners' approaches: ultrafast Raman spectroscopy with 1 microsecond time resolution and plasmonic nanopore-enhanced Raman sensors that have demonstrated single-molecule identification of 20 proteogenic amino acids, their post-translational modifications and discrimination of single amino acid residues within single peptides. Such achievement has addressed the long-standing challenge of current single-molecule technologies that cannot detect all 20 proteinogenic amino acids. Based on these approaches, the RamanProSeq project will integrate solid-state nanopores with a high-speed Raman detection system, an automated control system, computer simulations, and advanced Raman-based bioinformatics. The output of the project will be a novel nanopore-based device that will be used to sequence individual proteins at low concentrations and with high accuracy. The project will enable low cost, high resolution and high throughput in single-protein sequencing for a broad range of applications in life science and beyond.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

Palabras clave

Programa(s)

Tema(s)

Régimen de financiación

HORIZON-EIC - HORIZON EIC Grants

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Convocatoria de propuestas

(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-EIC-2025-PATHFINDEROPEN

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Coordinador

OULUN YLIOPISTO
Aportación neta de la UEn
€ 743 903,75
Dirección
PENTTI KAITERAN KATU 1
90014 Oulu
Finlandia
Región
Manner-Suomi Pohjois- ja Itä-Suomi Pohjois-Pohjanmaa
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total
€ 743 903,75

Participantes (5)