Objetivo
The next frontier in genomics is to understand and predict how the non-coding genome, including distal regulatory elements (enhancers), regulate precise patterns of gene expression. This is crucial to our understanding of development, evolution and disease, with huge clinical relevance to decode the vast majority of disease associated variants. Although many variants impact enhancers, it remains a major challenge to identify their target gene. This is largely because genes have many enhancers, often spanning great distances with many genes in between. How enhancers recognise the correct gene, ignoring others, remains one of the greatest mysteries in genome regulation. The factors involved and sequence-level determinants of enhancer-promoter (E-P) specificity remain elusive.
Here, we will combine systematic genetics, high-resolution genomics, and deep learning to perform the first large-scale functional dissection of the trans-factors and cis-regulatory features required for E-P looping and specificity in an in vivo context, using Drosophila embryogenesis. Drosophila has a track record of identifying conserved regulators of E-P communication from flies to man, including the discovery of Ldb1 and cohesin, and offers unmatched resources for this task: (a) genome-wide lines enabling tissue-specific knockdown of every gene; (b) efficient P-element transposon hopping, to force loops and sense enhancers to assess E-P specificity; (c) a near-complete map of regulatory elements for all embryonic stages. This proposal has three complementary Aims, to: 1) Identify new genes and cis-regulatory features functionally required for E-P looping; 2) Dissect, model, and predict sequence rules underlying E-P specificity & 3) Determine functional E-P pairs at scale by combining promoter engineering and mobilised enhancer sensors. Together, these approaches will provide unprecedented insights into regulatory specificity, transforming our understanding and decoding of genome regulation
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ingeniería y tecnología ingeniería eléctrica, ingeniería electrónica, ingeniería de la información ingeniería electrónica sensores
- ciencias naturales informática y ciencias de la información inteligencia artificial aprendizaje automático aprendizaje profundo
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2025-ADG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
69117 Heidelberg
Alemania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.