Obiettivo
The next frontier in genomics is to understand and predict how the non-coding genome, including distal regulatory elements (enhancers), regulate precise patterns of gene expression. This is crucial to our understanding of development, evolution and disease, with huge clinical relevance to decode the vast majority of disease associated variants. Although many variants impact enhancers, it remains a major challenge to identify their target gene. This is largely because genes have many enhancers, often spanning great distances with many genes in between. How enhancers recognise the correct gene, ignoring others, remains one of the greatest mysteries in genome regulation. The factors involved and sequence-level determinants of enhancer-promoter (E-P) specificity remain elusive.
Here, we will combine systematic genetics, high-resolution genomics, and deep learning to perform the first large-scale functional dissection of the trans-factors and cis-regulatory features required for E-P looping and specificity in an in vivo context, using Drosophila embryogenesis. Drosophila has a track record of identifying conserved regulators of E-P communication from flies to man, including the discovery of Ldb1 and cohesin, and offers unmatched resources for this task: (a) genome-wide lines enabling tissue-specific knockdown of every gene; (b) efficient P-element transposon hopping, to force loops and sense enhancers to assess E-P specificity; (c) a near-complete map of regulatory elements for all embryonic stages. This proposal has three complementary Aims, to: 1) Identify new genes and cis-regulatory features functionally required for E-P looping; 2) Dissect, model, and predict sequence rules underlying E-P specificity & 3) Determine functional E-P pairs at scale by combining promoter engineering and mobilised enhancer sensors. Together, these approaches will provide unprecedented insights into regulatory specificity, transforming our understanding and decoding of genome regulation
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- ingegneria e tecnologia ingegneria elettrica, ingegneria elettronica, ingegneria informatica ingegneria elettronica sensori
- scienze naturali informatica e scienze dell'informazione intelligenza artificiale apprendimento automatico apprendimento profondo
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2025-ADG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
69117 Heidelberg
Germania
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.