Ziel
The next frontier in genomics is to understand and predict how the non-coding genome, including distal regulatory elements (enhancers), regulate precise patterns of gene expression. This is crucial to our understanding of development, evolution and disease, with huge clinical relevance to decode the vast majority of disease associated variants. Although many variants impact enhancers, it remains a major challenge to identify their target gene. This is largely because genes have many enhancers, often spanning great distances with many genes in between. How enhancers recognise the correct gene, ignoring others, remains one of the greatest mysteries in genome regulation. The factors involved and sequence-level determinants of enhancer-promoter (E-P) specificity remain elusive.
Here, we will combine systematic genetics, high-resolution genomics, and deep learning to perform the first large-scale functional dissection of the trans-factors and cis-regulatory features required for E-P looping and specificity in an in vivo context, using Drosophila embryogenesis. Drosophila has a track record of identifying conserved regulators of E-P communication from flies to man, including the discovery of Ldb1 and cohesin, and offers unmatched resources for this task: (a) genome-wide lines enabling tissue-specific knockdown of every gene; (b) efficient P-element transposon hopping, to force loops and sense enhancers to assess E-P specificity; (c) a near-complete map of regulatory elements for all embryonic stages. This proposal has three complementary Aims, to: 1) Identify new genes and cis-regulatory features functionally required for E-P looping; 2) Dissect, model, and predict sequence rules underlying E-P specificity & 3) Determine functional E-P pairs at scale by combining promoter engineering and mobilised enhancer sensors. Together, these approaches will provide unprecedented insights into regulatory specificity, transforming our understanding and decoding of genome regulation
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Technik und Technologie Elektrotechnik, Elektronik, Informationstechnik Elektrotechnik Sensoren
- Naturwissenschaften Informatik und Informationswissenschaften künstliche Intelligenz maschinelles Lernen Deep Learning
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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(öffnet in neuem Fenster) ERC-2025-ADG
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
69117 Heidelberg
Deutschland
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.