Objetivo
Only ~1.5% of the human genome encodes proteins; the remaining 98.5%, once dismissed as “junk”, harbors the regulatory blueprint of life. Non-coding DNA controls when and where genes switch on by guiding transcription factor (TF) binding and nucleosome organization, shaping nuclear architecture. Yet how billions of weak, dispersed interactions achieve the high level of specificity required for gene regulation remains a central mystery. Isolated TF binding is far too weak: targeting a single genomic site in the human genome would require >20 kBT of discrimination, while typical TFs reach at most ~10 kBT. This order‑of‑magnitude lack of specificity implies that collective processes underpin mesoscale nuclear structure.
Our work shows that these collective processes are sequence‑guided: TFs can undergo sequence‑dependent prewetting transitions to form TF condensates at specific locations. DNA thus encodes a rugged energy landscape that programs where droplets, loops, and topologically associating domains (TADs) emerge. In collective processes many weak interactions can outcompete a few strong ones, but current approaches fail to capture the vast sequence space of weak binding. We will develop Ising-like models of TF-DNA binding with sub-kBT precision for any sequence, calibrated by competitive binding assays and validated using optical tweezers coupled with MINSTED nanoscopy for near base pair resolution imaging of TFs on stretched DNA. These models will underpin a theory of structure formation via sequence-guided condensation and wetting, tested through optical tweezer-based measurements of prewetting and co-condensation. We will apply this framework to investigate the physical basis of promoter-enhancer communication and TAD-scale genome folding, and evaluate its impact on gene expression levels in cells. This project will establish a physical foundation for sequence-guided genome organization at the mesoscale and its future exploration in development and disease.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias sociales sociología cuestiones sociales desigualdad social
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2025-ADG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
80539 MUNCHEN
Alemania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.