Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

DNA Sequence-Dependent Structure Formation in the Cell Nucleus

Cel

Only ~1.5% of the human genome encodes proteins; the remaining 98.5%, once dismissed as “junk”, harbors the regulatory blueprint of life. Non-coding DNA controls when and where genes switch on by guiding transcription factor (TF) binding and nucleosome organization, shaping nuclear architecture. Yet how billions of weak, dispersed interactions achieve the high level of specificity required for gene regulation remains a central mystery. Isolated TF binding is far too weak: targeting a single genomic site in the human genome would require >20 kBT of discrimination, while typical TFs reach at most ~10 kBT. This order‑of‑magnitude lack of specificity implies that collective processes underpin mesoscale nuclear structure.

Our work shows that these collective processes are sequence‑guided: TFs can undergo sequence‑dependent prewetting transitions to form TF condensates at specific locations. DNA thus encodes a rugged energy landscape that programs where droplets, loops, and topologically associating domains (TADs) emerge. In collective processes many weak interactions can outcompete a few strong ones, but current approaches fail to capture the vast sequence space of weak binding. We will develop Ising-like models of TF-DNA binding with sub-kBT precision for any sequence, calibrated by competitive binding assays and validated using optical tweezers coupled with MINSTED nanoscopy for near base pair resolution imaging of TFs on stretched DNA. These models will underpin a theory of structure formation via sequence-guided condensation and wetting, tested through optical tweezer-based measurements of prewetting and co-condensation. We will apply this framework to investigate the physical basis of promoter-enhancer communication and TAD-scale genome folding, and evaluate its impact on gene expression levels in cells. This project will establish a physical foundation for sequence-guided genome organization at the mesoscale and its future exploration in development and disease.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.

Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować

Słowa kluczowe

Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.

Program(-y)

Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.

Temat(-y)

Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.

System finansowania

Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2025-ADG

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Instytucja przyjmująca

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Wkład UE netto

Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.

€ 2 495 206,00
Koszt całkowity

Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.

Brak danych

Beneficjenci (1)