Descrizione del progetto
Un modello innovativo di apprendimento profondo per una progettazione efficiente dei peptidi
Le interazioni tra le proteine sono fondamentali per molti processi fisiologici e patologici nel corpo umano, il che le rende bersagli promettenti per il trattamento di malattie quali le infezioni batteriche e il cancro; ciononostante, l’uso terapeutico e la scoperta dei peptidi sono ostacolati da proprietà fisico-chimiche sfavorevoli e da metodi inefficienti, nonché ad alto consumo di risorse. Sostenuto dal programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto PeptimAIze svilupperà un modello di apprendimento profondo specializzato nella generazione di peptidi terapeutici per inibire le interazioni tra le proteine, affrontando a tal fine le lacune degli attuali approcci alla progettazione dei peptidi in questo tipo di tecnica sviluppando un modello con una migliore interpretabilità. Questo modello permetterà di superare i limiti esistenti, risultando al contempo più efficiente e accessibile.
Obiettivo
PeptimAIze aims to develop a deep learning model capable of generating therapeutic peptides for inhibiting protein-protein interactions (PPIs). Many PPIs are essential to key physiological and pathological processes, making these interactions ideal targets for selective intervention in several human diseases, including cancer and bacterial infections. However, the therapeutic potential of peptides is often limited by unfavorable physicochemical properties, such as low solubility and poor bioavailability. Current peptide discovery approaches are time- and resource-intensive, generating significant waste through iterative and labour-intensive screening of compound batches across multiple optimisation rounds to experimentally achieve the desired physicochemical properties. While deep learning and generative models have recently emerged for on-demand peptide design, most focus on a single aspect, typically binding affinity, disregarding physicochemical properties and experimental validation. PeptimAIze addresses these gaps by developing a multi-objective deep learning model based on protein language processing that designs peptides by co-optimising binding to the target and the physicochemical properties necessary for optimal administrability and bioavailability. The model will incorporate explainable AI techniques to enhance interpretability and reveal which amino acids in the peptide sequence are associated with the tuning of each considered property. A key step will be the wet-lab validation of the model on targets responsible for vital bacterial functions (Doc/Phd) and cancer development (p53/MDM2 and Bcl-xL/Bak), demonstrating real-world lab applicability. To maximise impact and usability, the model will be deployed through an intuitive, user-friendly app, enabling researchers in academia and industry to design peptides with tailored properties.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze mediche e della salute medicina clinica oncologia
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2025-PF
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
SW7 2AZ London
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.