Objetivo
MODIFy (Multi-Omic study of transcription factor Dose-Induced cell Fate) is a multimodal experimental and computational project aimed at dissecting the interplay between human genetic variability and transcription factor (TF) dose in the context of human induced pluripotent stem cell (hiPSC) differentiation.
Transcription factors (TFs) establish a cell’s gene expression profile, and their overexpression can induce cell state and even cell identity changes such as reprogramming of human somatic cells into hiPSCs. hiPSCs can then be differentiated into specific cell types for therapeutic purposes. However, hiPSC differentiation is highly heterogeneous and inefficient. This is due to molecular complexities including variability in the expression levels of the inducing TFs and differences in pluripotency among hiPSC lines, which can be driven by genetic variation.
MODIFy aims to dissect the determinants of hiPSC differentiation heterogeneity by studying the interplay between TF expression level (dose) and genetic background at the single cell level. To this end, I will build on scTF-seq, a method developed in the Deplancke lab that enables systematic assessment of TF-induced cell state transitions across a wide dose range with single cell RNA sequencing (scRNA-seq). I will extend scTF-seq by incorporating a multimodal readout that combines transcriptomic and chromatin accessibility profiling, and apply it to genetically different hiPSC lines. This will allow me to decipher the gene regulatory networks activated at different TF doses and uncover how genetic variation influences them by modulating TF dose sensitivity. By combining my experience in in vitro differentiation, method development and bioinformatics with the expertise of Prof. Deplancke’s lab in scRNA-seq this project will yield fundamental insights into how TF dose and genotype interact to control cell fate,ultimately guiding improved strategies for cell engineering across diverse human genetic background.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias médicas y de la salud biotecnología médica tecnologías celulares células madre
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2025-PF
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
1015 LAUSANNE
Suiza
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.