Obiettivo
MODIFy (Multi-Omic study of transcription factor Dose-Induced cell Fate) is a multimodal experimental and computational project aimed at dissecting the interplay between human genetic variability and transcription factor (TF) dose in the context of human induced pluripotent stem cell (hiPSC) differentiation.
Transcription factors (TFs) establish a cell’s gene expression profile, and their overexpression can induce cell state and even cell identity changes such as reprogramming of human somatic cells into hiPSCs. hiPSCs can then be differentiated into specific cell types for therapeutic purposes. However, hiPSC differentiation is highly heterogeneous and inefficient. This is due to molecular complexities including variability in the expression levels of the inducing TFs and differences in pluripotency among hiPSC lines, which can be driven by genetic variation.
MODIFy aims to dissect the determinants of hiPSC differentiation heterogeneity by studying the interplay between TF expression level (dose) and genetic background at the single cell level. To this end, I will build on scTF-seq, a method developed in the Deplancke lab that enables systematic assessment of TF-induced cell state transitions across a wide dose range with single cell RNA sequencing (scRNA-seq). I will extend scTF-seq by incorporating a multimodal readout that combines transcriptomic and chromatin accessibility profiling, and apply it to genetically different hiPSC lines. This will allow me to decipher the gene regulatory networks activated at different TF doses and uncover how genetic variation influences them by modulating TF dose sensitivity. By combining my experience in in vitro differentiation, method development and bioinformatics with the expertise of Prof. Deplancke’s lab in scRNA-seq this project will yield fundamental insights into how TF dose and genotype interact to control cell fate,ultimately guiding improved strategies for cell engineering across diverse human genetic background.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze mediche e della salute biotecnologia medica tecnologie cellulari cellule staminali
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2025-PF
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
1015 Lausanne
Svizzera
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.