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Discovery and evolution of CRISPR-Associated Transposons (CAST) for functional RNA-guided integration

Ziel

CRISPR-Cas nucleases have revolutionized genome editing but remain limited by their reliance on DNA double-strand breaks (DSBs), which restricts safe and efficient integration of large DNA cargos, particularly in non-dividing cells. CRISPR-associated transposons (CASTs) offer a promising alternative: they enable RNA-guided integration of large DNA cargos without DSBs. However, most systems remain poorly characterized and show low or unreported activity in mammalian systems.
The CRAFT project (CRISPR-Associated Transposons for RNA-guided Functional inTegration) will address these gaps by combining discovery, functional characterization, and directed evolution of novel CASTs. I will mine ancient marine metagenomes, shaped by millennia of virus–host co-evolution, to identify novel CASTs. Selected candidates will be biochemically and functionally characterized, using ddPCR and next-generation sequencing to map precise insertion events in bacteria and human cells. Promising systems will be optimized via Phage-Assisted Continuous Evolution (PACE) to improve integration efficiency and precision.
CRAFT goes beyond current technologies by establishing a full discovery-to-application pipeline for CASTs in eukaryotic cells. Expected results include a curated open-access dataset of novel CASTs and optimized variants for therapeutic and biotechnological applications. These advances will expand the genome-editing toolbox, support personalized medicine (e.g. cystic fibrosis), and create opportunities in agriculture and synthetic biology.
This fellowship will strengthen my expertise at the interface of gene editing, bioinformatics, and synthetic biology, preparing me to establish an independent research group. By advancing CAST discovery and evolution, CRAFT will contribute to Europe’s leadership in next-generation genome engineering with clear scientific, societal, and economic impact.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2025-PF

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 263 393,28
Adresse
NORREGADE 10
1165 KOBENHAVN
Dänemark

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Region
Danmark Hovedstaden Byen København
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten