Objectif
Most bacteria carry chromosomally integrated viral mobile genetic elements – prophages. Although parasitic, prophages can benefit their host via genes with systems to defend the host from infection by other phages. How does conflict between these phages shape the evolution and the spread of the defensive genes?
I aim to study how prophage-mediated anti-viral defence spreads through populations of the pathogen Pseudomonas aeruginosa. Preliminary data shows that prophages can provide hosts with different profiles of resistance against virulent (non-integrating) phages. I will first identify the genetic bases of these defences and how they act, then establish a novel multiplexed fluorescence-based system to follow the vertical selection and horizontal transmission of defensive prophages, in the presence of virulent phages. This dynamic system will provide the basis for establishing, in collaboration, a more generalisable mathematical model of prophage spread in bacterial population. Finally, I will use evolution experiments to determine if and how virulent phages can mutate to escape this resistance. This project will advance our knowledge as to what extend the myriads of prophages residing in bacterial genomes may alter phage resistance phenotypes of their hosts and drive the horizontal propagation of defensive genes to new hosts. This study is pertinent to clinical applications of phages as the spread of prophage-encoded defence systems could undermine the outcomes of phage-based therapies.
This multidisciplinary project integrates my expertise in genetic engineering and experimental evolution with that of the host lab in phage molecular biology and ecology. A strong dissemination and communication plan will ensure relevant stakeholders – policy makers, clinicians, and scientific audiences – have access to key findings. Working within the CNRS gives me access to high quality equipment, collaborations and training to propel my career as an independent research.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie virologie
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie résistance aux médicaments résistance multiple aux médicaments
- sciences naturelles mathématiques mathématiques appliquées modèle mathématique
- sciences naturelles sciences biologiques biologie moléculaire
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2025-PF
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
75794 PARIS
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.