Projektbeschreibung
Die Evolution der Virusresistenz bei Bakterien nachverfolgen
Während Bakterien und ihre viralen Parasiten in einem ständigen evolutionären Konflikt stehen, können die genetischen Elemente, die sie untereinander austauschen, die Ausbreitung von Resistenzen auf neue Weise prägen. Das Team des innerhalb der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen unterstützten Projekts ProSAR untersucht, wie Prophagen (in bakterielle Genome integrierte virale Elemente) die antivirale Abwehr des Erregers Pseudomonas aeruginosa beeinflussen. Obwohl Prophagen oft parasitär sind, können sie ihren Wirten Gene liefern, die vor einer Infektion durch andere Phagen schützen. Im Rahmen des Projekts wird ein multiplexer Fluoreszenzansatz entwickelt, um nachzuverfolgen, wie sich schützende Prophagen unter viralem Druck innerhalb von Bakterienpopulationen ausbreiten. Mithilfe experimenteller Evolution und mathematischer Modellierung wird der Frage nachgegangen, ob virulente Phagen sich auf eine Weise weiterentwickeln können, dass sie diesen Schutz überwinden. In ihrer Gesamtheit könnten die Ergebnisse dazu beitragen, die Wirksamkeit zukünftiger phagenbasierter Therapien zu verbessern.
Ziel
Most bacteria carry chromosomally integrated viral mobile genetic elements – prophages. Although parasitic, prophages can benefit their host via genes with systems to defend the host from infection by other phages. How does conflict between these phages shape the evolution and the spread of the defensive genes?
I aim to study how prophage-mediated anti-viral defence spreads through populations of the pathogen Pseudomonas aeruginosa. Preliminary data shows that prophages can provide hosts with different profiles of resistance against virulent (non-integrating) phages. I will first identify the genetic bases of these defences and how they act, then establish a novel multiplexed fluorescence-based system to follow the vertical selection and horizontal transmission of defensive prophages, in the presence of virulent phages. This dynamic system will provide the basis for establishing, in collaboration, a more generalisable mathematical model of prophage spread in bacterial population. Finally, I will use evolution experiments to determine if and how virulent phages can mutate to escape this resistance. This project will advance our knowledge as to what extend the myriads of prophages residing in bacterial genomes may alter phage resistance phenotypes of their hosts and drive the horizontal propagation of defensive genes to new hosts. This study is pertinent to clinical applications of phages as the spread of prophage-encoded defence systems could undermine the outcomes of phage-based therapies.
This multidisciplinary project integrates my expertise in genetic engineering and experimental evolution with that of the host lab in phage molecular biology and ecology. A strong dissemination and communication plan will ensure relevant stakeholders – policy makers, clinicians, and scientific audiences – have access to key findings. Working within the CNRS gives me access to high quality equipment, collaborations and training to propel my career as an independent research.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Mikrobiologie Bakteriologie
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Mikrobiologie Virologie
- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Grundlagenmedizin Pharmakologie und Pharmazie Arzneimittelresistenz Multiresistenz
- Naturwissenschaften Mathematik angewandte Mathematik mathematisches Modell
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Molekularbiologie
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2025-PF
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
75794 Paris
Frankreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.