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Role of prophages in the evolution and spread of antiviral resistance in Pseudomonas aeruginosa

Obiettivo

Most bacteria carry chromosomally integrated viral mobile genetic elements – prophages. Although parasitic, prophages can benefit their host via genes with systems to defend the host from infection by other phages. How does conflict between these phages shape the evolution and the spread of the defensive genes?
I aim to study how prophage-mediated anti-viral defence spreads through populations of the pathogen Pseudomonas aeruginosa. Preliminary data shows that prophages can provide hosts with different profiles of resistance against virulent (non-integrating) phages. I will first identify the genetic bases of these defences and how they act, then establish a novel multiplexed fluorescence-based system to follow the vertical selection and horizontal transmission of defensive prophages, in the presence of virulent phages. This dynamic system will provide the basis for establishing, in collaboration, a more generalisable mathematical model of prophage spread in bacterial population. Finally, I will use evolution experiments to determine if and how virulent phages can mutate to escape this resistance. This project will advance our knowledge as to what extend the myriads of prophages residing in bacterial genomes may alter phage resistance phenotypes of their hosts and drive the horizontal propagation of defensive genes to new hosts. This study is pertinent to clinical applications of phages as the spread of prophage-encoded defence systems could undermine the outcomes of phage-based therapies.
This multidisciplinary project integrates my expertise in genetic engineering and experimental evolution with that of the host lab in phage molecular biology and ecology. A strong dissemination and communication plan will ensure relevant stakeholders – policy makers, clinicians, and scientific audiences – have access to key findings. Working within the CNRS gives me access to high quality equipment, collaborations and training to propel my career as an independent research.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2025-PF

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 242 260,56
Indirizzo
RUE MICHEL ANGE 3
75794 PARIS
Francia

Mostra sulla mappa

Regione
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato
Il mio fascicolo 0 0