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Uncovering the regulation of transthiolating and RING E3 ligase activity by metabolites

Description du projet

La régulation du système de l’ubiquitine par les métabolites

Le système de l’ubiquitine est un mécanisme cellulaire fondamental qui marque les protéines en vue de leur dégradation, de leur transport ou de leur modification fonctionnelle. Ce processus est orchestré par environ 650 enzymes spécialisées, appelées ligases E3, dont l’activité doit être étroitement régulée. L’ubiquitination anormale est une caractéristique majeure du cancer et de la neurodégénérescence. Cependant, la manière dont les métabolites intracellulaires influencent l’activité des ligases E3 reste encore largement méconnue. Soutenu par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet urTREAM vise à étudier cette interaction entre les métabolites et les ligases E3 à l’aide d’une approche pluridisciplinaire. Il permettra de mieux comprendre les mécanismes fondamentaux régissant la régulation de l’ubiquitine et pourrait potentiellement déboucher sur la découverte de nouvelles cibles thérapeutiques.

Objectif

The ubiquitin system, a central regulator of cellular processes, relies on the activity of approximately 650 E3 ligases to mediate the ubiquitination of cellular entities. This activity is tightly regulated to avoid aberrant ubiquitination, a hallmark of numerous diseases. While several regulatory layers of ligase activity have been documented, a novel factor – activity control by metabolites – remains vastly underexplored. A key bottleneck for uncovering metabolite-driven regulation has been the lack of appropriate tools for activity read-out of cellular ligases. However, in the past few years, innovative activity-based probes have been added to our toolbox.

In this proposal, I will exploit complementary E2~Ub-mimicking probes to monitor the proteome-wide activity of both transthiolating and single subunit RING E3 ligases after manipulation of intracellular metabolite pools. By coupling mass-spectrometry-aided ligase-agnostic profiling with biophysical characterisation of the interaction, I will chart the metabolite E3 landscape, deepen our mechanistic understanding of ubiquitin regulation, and uncover new therapeutic entry points for diseases such as cancer and neurodegeneration.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

Mots‑clés

Programme(s)

Thème(s)

Régime de financement

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

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Appel à propositions

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2025-PF

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Coordinateur

UNIVERSITY OF DUNDEE
Contribution nette de l'UE
€ 260 347,92
Adresse
Nethergate
DD1 4HN Dundee
Royaume-Uni
Région
Scotland Eastern Scotland Angus and Dundee City
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total
Aucune donnée