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RANGE – Recombination And geNomic architecture in Genomic Erosion

Descrizione del progetto

Come l’architettura del genoma influenza l’erosione genomica negli uccelli minacciati

L’erosione genomica – la progressiva perdita di diversità genetica a livello dell’intero genoma e l’accumulo di mutazioni dannose all’interno di una popolazione nel corso del tempo – è causata dalla consanguineità e dalla deriva genetica nelle popolazioni di piccole dimensioni. Diminuisce la capacità di una specie di adattarsi ai cambiamenti ambientali, riduce la vitalità della popolazione e aumenta il rischio di estinzione. Comprendere i suoi meccanismi è essenziale per la conservazione. Grazie al sostegno del programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto RANGE si propone di svelare le regole precise che governano l’erosione genomica. Verranno analizzati i modelli di erosione genomica nei paesaggi di ricombinazione e nell’architettura del genoma. Combinando la mappatura genomica ad alta risoluzione, il tracciamento degli aplotipi basato sugli alberi genealogici e le simulazioni predittive, RANGE svilupperà un quadro meccanicistico che collegherà le caratteristiche del genoma all’erosione genomica nelle specie di uccelli in via di estinzione.

Obiettivo

Understanding how threatened populations lose genetic diversity is a fundamental challenge in evolutionary biology and conservation. Genomic erosion—the loss of diversity and accumulation of harmful mutations—reduces adaptive potential, drives inbreeding depression, and increases extinction risk. Yet, we still lack predictive models of how erosion unfolds across the genome during population decline. In RANGE, my aim is to test how recombination landscapes and genome architecture shape genomic erosion, moving beyond genome-wide averages to reveal fine-scale rules that govern genetic diversity loss.
The project combines three components: (i) Develop genomic resources by building high-resolution recombination maps, analysing high-quality reference genomes, and reconstructing founder haplotypes in four endangered bird species with exceptional temporal and pedigree data. (ii) Explain patterns of genomic erosion by tracking haplotype segments through pedigrees and applying simulations to disentangle the contributions of recombination, drift, and gene conversion. (iii) Establish a predictive framework that integrates empirical patterns with forward-time models (SLiM) to generalise findings across genomes and species.
By explicitly incorporating recombination landscapes into temporal genomic analyses, RANGE will, for the first time, test whether genomic features can predict the locations and patterns of load accumulation in threatened birds. This integration of evolutionary theory, high-quality temporal genomics, and conservation will transform our understanding of genomic erosion, delivering conceptual advances and practical insights into how genome architecture shapes diversity in small populations.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

Parole chiave

Programma(i)

Argomento(i)

Meccanismo di finanziamento

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

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Invito a presentare proposte

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2025-PF

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Coordinatore

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Contributo netto dell'UE
€ 247 553,28
Indirizzo
NORREGADE 10
1165 KOBENHAVN
Danimarca
Regione
Danmark Hovedstaden Byen København
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale
Nessun dato