Objectif
Bacteria constituting the gut microbiome play a crucial role metabolizing dietary fats. How these bacteria physically interact with these fats is unknown. LIPTO will provide direct visual insight into this process and translate them into quantitative, predictive tools. LIPTO hypothesizes that topological defects created by dense bacterial biofilms act as physical and metabolical hotspots.
It will pursue three integrated objectives. O1 quantifies how gut-relevant bacteria remodel oil droplets under controlled conditions. Using anaerobic microfluidic chips and live confocal imaging, it will measure attachment, growth and interface deformation (area and curvature change) while extracting orientation fields to locate nematic order and defects. O2 tests whether mechanical states map to transcriptional states. A microfluidics-compatible smFISH panel targeting lipid metabolism, stress responses and surface sensing will read out gene expression directly inside structured biofilms, allowing a cell-resolved comparison of defect-rich and smooth regions. O3 develops computational models that link bacterial alignment, curvature, and stress to lipid access, validating them against the movies and gene data and releasing open code and datasets.
The project is firmly interdisciplinary combining soft-matter physics, microfluidics, quantitative imaging and spatial omics, with expert supervision at Sorbonne Université and collaborations in active-matter theory. Results will advance fundamental understanding of living interfaces and generate reusable methods for analyzing bacterial biofilm mechanics. Societally, the work informs microbiome strategies for dietary lipid control, aligning with Horizon Europe Cluster 1 and SDG 3 (health and well-being). Training spans advanced imaging, transcriptomics, modeling, and a non-academic placement (NAP) focused on valorisation.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences physiques mécanique classique mécanique des fluides microfluidics
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences physiques physique de la matière condensée physique de la matière molle
- lettres arts art contemporain et moderne film
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie microscopie confocale
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2025-PF
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
75006 Paris
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.