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When bacteria meet fats: the physics of bacterial ordering, surface deformation and gene activity

Obiettivo

Bacteria constituting the gut microbiome play a crucial role metabolizing dietary fats. How these bacteria physically interact with these fats is unknown. LIPTO will provide direct visual insight into this process and translate them into quantitative, predictive tools. LIPTO hypothesizes that topological defects created by dense bacterial biofilms act as physical and metabolical hotspots.
It will pursue three integrated objectives. O1 quantifies how gut-relevant bacteria remodel oil droplets under controlled conditions. Using anaerobic microfluidic chips and live confocal imaging, it will measure attachment, growth and interface deformation (area and curvature change) while extracting orientation fields to locate nematic order and defects. O2 tests whether mechanical states map to transcriptional states. A microfluidics-compatible smFISH panel targeting lipid metabolism, stress responses and surface sensing will read out gene expression directly inside structured biofilms, allowing a cell-resolved comparison of defect-rich and smooth regions. O3 develops computational models that link bacterial alignment, curvature, and stress to lipid access, validating them against the movies and gene data and releasing open code and datasets.
The project is firmly interdisciplinary combining soft-matter physics, microfluidics, quantitative imaging and spatial omics, with expert supervision at Sorbonne Université and collaborations in active-matter theory. Results will advance fundamental understanding of living interfaces and generate reusable methods for analyzing bacterial biofilm mechanics. Societally, the work informs microbiome strategies for dietary lipid control, aligning with Horizon Europe Cluster 1 and SDG 3 (health and well-being). Training spans advanced imaging, transcriptomics, modeling, and a non-academic placement (NAP) focused on valorisation.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2025-PF

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

SORBONNE UNIVERSITE
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 226 420,56
Indirizzo
21 RUE DE L'ECOLE DE MEDECINE
75006 Paris
Francia

Mostra sulla mappa

Regione
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato