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When bacteria meet fats: the physics of bacterial ordering, surface deformation and gene activity

Ziel

Bacteria constituting the gut microbiome play a crucial role metabolizing dietary fats. How these bacteria physically interact with these fats is unknown. LIPTO will provide direct visual insight into this process and translate them into quantitative, predictive tools. LIPTO hypothesizes that topological defects created by dense bacterial biofilms act as physical and metabolical hotspots.
It will pursue three integrated objectives. O1 quantifies how gut-relevant bacteria remodel oil droplets under controlled conditions. Using anaerobic microfluidic chips and live confocal imaging, it will measure attachment, growth and interface deformation (area and curvature change) while extracting orientation fields to locate nematic order and defects. O2 tests whether mechanical states map to transcriptional states. A microfluidics-compatible smFISH panel targeting lipid metabolism, stress responses and surface sensing will read out gene expression directly inside structured biofilms, allowing a cell-resolved comparison of defect-rich and smooth regions. O3 develops computational models that link bacterial alignment, curvature, and stress to lipid access, validating them against the movies and gene data and releasing open code and datasets.
The project is firmly interdisciplinary combining soft-matter physics, microfluidics, quantitative imaging and spatial omics, with expert supervision at Sorbonne Université and collaborations in active-matter theory. Results will advance fundamental understanding of living interfaces and generate reusable methods for analyzing bacterial biofilm mechanics. Societally, the work informs microbiome strategies for dietary lipid control, aligning with Horizon Europe Cluster 1 and SDG 3 (health and well-being). Training spans advanced imaging, transcriptomics, modeling, and a non-academic placement (NAP) focused on valorisation.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2025-PF

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

SORBONNE UNIVERSITE
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 226 420,56
Adresse
21 RUE DE L'ECOLE DE MEDECINE
75006 Paris
Frankreich

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Region
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

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