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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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OUTBreak AI-driven Detection: Enhancing MALDI-TOF outbreak detection with multimodal AI integrating epidemiological and genomic data

Objetivo

Hospital-acquired infections (HAIs) from resistant and hypervirulent bacteria—such as Methicillin-resistant Staphylococcus aureus, Vancomycin-resistant Enterococcus faecium, Carbapenemase-producing Pseudomonas aeruginosa, Carbapenemase-producing Acinetobacter baumannii, and Clostridioides difficile—pose a growing threat to patient safety worldwide. Outbreaks often go undetected until severe harm occurs. While whole genome sequencing (WGS) is the gold standard for outbreak tracing, it is costly, slow and not globally accessible. MALDI-TOF mass spectrometry, in contrast, is rapid and widely used, but its outbreak detection potential remains unexploited.

The OUTBReak AI-driven Detection (OUTBRAID) project will transform hospital outbreak surveillance by leveraging an unprecedented international dataset—over 1.2 million MALDI-TOF spectra already collected at the IMM Zurich, plus new contributions from 9 countries across Europe, Asia, and Australia, including Low and Median Income Countries (LMICs), each providing at least 100 samples per pathogen for rigorous, external validation.

OUTBRAID will develop two breakthrough approaches: (1) diffusion models to generate synthetic MALDI-TOF spectra, ensuring robust, cross-center performance; and (2) multimodal machine learning that combines MALDI-TOF, epidemiological metadata, and WGS to enable automated, high-resolution cluster detection. These models will be benchmarked not only at species level but also at sequence type (ST), cgMLST, and single-nucleotide polymorphism (SNP) resolution—pushing MALDI-TOF as close as possible to the granularity of WGS.

All data, models, and code will be open access. OUTBRAID’s participation in workshops and training will reach and train 150+ scientists and clinicians (e.g. ESCMID), ensuring broad impact. By braiding together international data streams and AI, OUTBRAID aims to deliver scalable tools for early outbreak detection, supporting hospitals and public health globally.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2025-PF

Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoria

Coordinador

UNIVERSITAT ZURICH
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 307 958,88
Dirección
RAMISTRASSE 71
8006 Zurich
Suiza

Ver en el mapa

Región
Schweiz/Suisse/Svizzera Zürich Zürich
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

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Socios (1)

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