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OUTBreak AI-driven Detection: Enhancing MALDI-TOF outbreak detection with multimodal AI integrating epidemiological and genomic data

Ziel

Hospital-acquired infections (HAIs) from resistant and hypervirulent bacteria—such as Methicillin-resistant Staphylococcus aureus, Vancomycin-resistant Enterococcus faecium, Carbapenemase-producing Pseudomonas aeruginosa, Carbapenemase-producing Acinetobacter baumannii, and Clostridioides difficile—pose a growing threat to patient safety worldwide. Outbreaks often go undetected until severe harm occurs. While whole genome sequencing (WGS) is the gold standard for outbreak tracing, it is costly, slow and not globally accessible. MALDI-TOF mass spectrometry, in contrast, is rapid and widely used, but its outbreak detection potential remains unexploited.

The OUTBReak AI-driven Detection (OUTBRAID) project will transform hospital outbreak surveillance by leveraging an unprecedented international dataset—over 1.2 million MALDI-TOF spectra already collected at the IMM Zurich, plus new contributions from 9 countries across Europe, Asia, and Australia, including Low and Median Income Countries (LMICs), each providing at least 100 samples per pathogen for rigorous, external validation.

OUTBRAID will develop two breakthrough approaches: (1) diffusion models to generate synthetic MALDI-TOF spectra, ensuring robust, cross-center performance; and (2) multimodal machine learning that combines MALDI-TOF, epidemiological metadata, and WGS to enable automated, high-resolution cluster detection. These models will be benchmarked not only at species level but also at sequence type (ST), cgMLST, and single-nucleotide polymorphism (SNP) resolution—pushing MALDI-TOF as close as possible to the granularity of WGS.

All data, models, and code will be open access. OUTBRAID’s participation in workshops and training will reach and train 150+ scientists and clinicians (e.g. ESCMID), ensuring broad impact. By braiding together international data streams and AI, OUTBRAID aims to deliver scalable tools for early outbreak detection, supporting hospitals and public health globally.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2025-PF

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

UNIVERSITAT ZURICH
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 307 958,88
Adresse
RAMISTRASSE 71
8006 Zurich
Schweiz

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Region
Schweiz/Suisse/Svizzera Zürich Zürich
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten

Partner (1)

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