Description du projet
Les mécanismes de la coexistence des phages et des bactéries dans l’intestin
Les phages jouent un rôle essentiel dans la diversité microbienne intestinale et la santé humaine. Leurs mécanismes d’interaction avec les bactéries sont toutefois encore mal compris, ce qui entrave les études sur les microbiomes et les thérapies basées sur les phages. Soutenu par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet COEXIGUT va se pencher sur les mécanismes qui sous-tendent la coexistence des phages et des bactéries dans l’environnement intestinal. Avec Escherichia coli, Enterococcus faecalis et leurs phages comme systèmes modèles, le projet va développer des systèmes in vitro pour explorer les effets de la composition chimique des nutriments et/ou de la diversité des populations sur la coexistence. Il analysera également les signatures protéomiques et génomiques associées à la résistance et à la persistance des phages et des bactéries.
Objectif
Bacteriophages (phages) are major drivers of microbial diversity and ecosystem function in many habitats. In the human gut, they play a crucial role in shaping bacterial populations, influencing host health and microbiome stability. While several studies have revealed that phages and their bacterial hosts can coexist for extended periods, the mechanisms underlying this long-term coexistence remain largely unknown. Understanding how such stability is maintained is essential for both fundamental microbiome research and the development of phage-based therapies.
This project aims to dissect some of the molecular and ecological mechanisms that sustain stable phage-bacterial coexistence in the gut. Using Escherichia coli and Enterococcus faecalis (two commensal species commonly found in the intestinal microbiota) and their corresponding phages, I will establish controlled in vitro systems to study how factors such as nutrient composition, community complexity, and culture conditions influence coexistence dynamics. Combining these assays with deep sequencing, metabolomics and proteomics, genomic changes and molecular pathways involved in resistance and phage persistence will be decoded. The functional role will be validated through the knockdown of the identified pathways and, ultimately, tested in gnotobiotic mice colonized with the OMM12 synthetic microbial community.
The expected outcome is a detailed mechanistic understanding of how phages and their hosts coexist over time in the gut environment. By uncovering the key genetic and ecological factors involved, this project will provide fundamental insights into microbiome resilience and control. This knowledge will also help inform the rational design of microbiome-targeted interventions and improve the predictability and safety of phage therapy in clinical settings.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
- sciences naturelles sciences biologiques écologie écosystème
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2025-PF
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
80333 Muenchen
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.