Descrizione del progetto
Meccanismi che consentono la coesistenza tra fagi e batteri nell’intestino
I fagi svolgono un ruolo importante nella diversità microbica intestinale e nella salute umana. Tuttavia, i meccanismi della loro interazione con i batteri sono ancora poco chiari, il che ostacola gli studi sui microbiomi e le terapie basate sui fagi. Sostenuto dal programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto COEXIGUT esaminerà i meccanismi che rendono possibile la coesistenza di fagi e batteri nell’ambiente intestinale. Utilizzando Escherichia coli, Enterococcus faecalis e i loro fagi come sistemi modello, il progetto svilupperà sistemi in vitro per esplorare gli effetti della composizione chimica dei nutrienti e/o della diversità delle popolazioni sulla coesistenza. Inoltre, il progetto analizzerà le firme proteomiche e genomiche associate alla resistenza e alla persistenza dei fagi e dei batteri.
Obiettivo
Bacteriophages (phages) are major drivers of microbial diversity and ecosystem function in many habitats. In the human gut, they play a crucial role in shaping bacterial populations, influencing host health and microbiome stability. While several studies have revealed that phages and their bacterial hosts can coexist for extended periods, the mechanisms underlying this long-term coexistence remain largely unknown. Understanding how such stability is maintained is essential for both fundamental microbiome research and the development of phage-based therapies.
This project aims to dissect some of the molecular and ecological mechanisms that sustain stable phage-bacterial coexistence in the gut. Using Escherichia coli and Enterococcus faecalis (two commensal species commonly found in the intestinal microbiota) and their corresponding phages, I will establish controlled in vitro systems to study how factors such as nutrient composition, community complexity, and culture conditions influence coexistence dynamics. Combining these assays with deep sequencing, metabolomics and proteomics, genomic changes and molecular pathways involved in resistance and phage persistence will be decoded. The functional role will be validated through the knockdown of the identified pathways and, ultimately, tested in gnotobiotic mice colonized with the OMM12 synthetic microbial community.
The expected outcome is a detailed mechanistic understanding of how phages and their hosts coexist over time in the gut environment. By uncovering the key genetic and ecological factors involved, this project will provide fundamental insights into microbiome resilience and control. This knowledge will also help inform the rational design of microbiome-targeted interventions and improve the predictability and safety of phage therapy in clinical settings.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine proteomica
- scienze naturali scienze biologiche ecologia ecosistemi
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2025-PF
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
80333 Muenchen
Germania
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.