Projektbeschreibung
Mechanismen, welche die Koexistenz von Phagen und Bakterien im Darm ermöglichen
Phagen spielen eine wichtige Rolle für die mikrobielle Vielfalt im Darm und die menschliche Gesundheit. Ihre Wechselwirkungsmechanismen mit Bakterien sind jedoch noch weitgehend unverstanden, was sich auf die Erforschung von Mikrobiomen und auf Phagen basierende Therapien auswirkt. Das durch die Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen geförderte Projekt COEXIGUT wird die Mechanismen untersuchen, die die Koexistenz von Phagen und Bakterien im Darm ermöglichen. Anhand von Escherichia coli, Enterococcus faecalis und deren Phagen als Modellsysteme wird das Projekt In-vitro-Systeme entwickeln, um die Auswirkungen der chemischen Zusammensetzung der Nährstoffe und/oder der Populationsvielfalt auf die Koexistenz zu untersuchen. Darüber hinaus wird das Projekt die proteomischen und genomischen Signaturen analysieren, die mit Resistenzen und der Persistenz von Phagen und Bakterien in Verbindung stehen.
Ziel
Bacteriophages (phages) are major drivers of microbial diversity and ecosystem function in many habitats. In the human gut, they play a crucial role in shaping bacterial populations, influencing host health and microbiome stability. While several studies have revealed that phages and their bacterial hosts can coexist for extended periods, the mechanisms underlying this long-term coexistence remain largely unknown. Understanding how such stability is maintained is essential for both fundamental microbiome research and the development of phage-based therapies.
This project aims to dissect some of the molecular and ecological mechanisms that sustain stable phage-bacterial coexistence in the gut. Using Escherichia coli and Enterococcus faecalis (two commensal species commonly found in the intestinal microbiota) and their corresponding phages, I will establish controlled in vitro systems to study how factors such as nutrient composition, community complexity, and culture conditions influence coexistence dynamics. Combining these assays with deep sequencing, metabolomics and proteomics, genomic changes and molecular pathways involved in resistance and phage persistence will be decoded. The functional role will be validated through the knockdown of the identified pathways and, ultimately, tested in gnotobiotic mice colonized with the OMM12 synthetic microbial community.
The expected outcome is a detailed mechanistic understanding of how phages and their hosts coexist over time in the gut environment. By uncovering the key genetic and ecological factors involved, this project will provide fundamental insights into microbiome resilience and control. This knowledge will also help inform the rational design of microbiome-targeted interventions and improve the predictability and safety of phage therapy in clinical settings.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine Proteomik
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Ökologie Ökosystem
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2025-PF
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
80333 Muenchen
Deutschland
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.