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Elucidation of dynamics and impact of geminivirus-induced reorganization of cellular chromatin

Obiettivo

Viruses are obligate parasites that manipulate host proteins and structures to complete their life cycle and cause devastating diseases in animals and plants, impacting global health, food security, and economies. Some DNA viruses that target nucleus as their site of replication can induce drastic changes in the nuclear architecture termed “reorganization of cellular chromatin” (ROCC). ROCC is characterized by condensation and margination of host chromatin. It has been observed in infections by five different DNA virus families with hosts across kingdoms. Given the polyphyletic origins of these virus families, ROCC is suggested to result from a convergently evolved viral infection strategy. However, despite its wide incidence, how ROCC starts, proceeds, and impacts host and virus is yet to be fully explored. Here, we propose to characterize the dynamics and impact of ROCC on virus and host during geminivirus infection in plants, using confocal microscopy and laser microdissection combined with omics approach. Firstly, we will track and define phenotypes of ROCC phases by imaging host chromatin. Secondly, we will monitor the localizations of host and viral DNA as well as proteins associated with viral life cycle during ROCC. Finally, we will isolate the nuclei at different phases of ROCC by laser microdissection and analyze phase-specific nuclear transcriptomics, chromatin accessibility and conformation, as well as proteomics. Together, the results from this project will shed light on the spatiotemporal dynamics and significance of nuclear reorganization induced by geminiviruses. Characterizing ROCC may lead not only to the deeper understanding of the nuclear viral replication mechanism but also to new crop breeding strategies for resistance against geminiviruses. Ultimately, the results may also contribute to new therapeutic strategies against important animal-infecting viruses that also induce ROCC.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2025-PF

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

EBERHARD KARLS UNIVERSITAET TUEBINGEN
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 217 965,12
Indirizzo
GESCHWISTER-SCHOLL-PLATZ
72074 Tuebingen
Germania

Mostra sulla mappa

Regione
Baden-Württemberg Tübingen Tübingen, Landkreis
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato
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