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Mechanisms of mChr-mediated genome dynamics in the cereal blast fungus Magnaporthe oryzae

Obiettivo

Plant pathogenic fungi represent a serious threat for the productivity of agricultural systems. The blast fungus Magnaporthe oryzae is a multi-host pathogen that infects both, cultivated and wild grass species, including important agronomic crops such as rice, wheat and barley. Despite reproducing asexually, clonal lineages of the blast fungus display remarkable genomic and phenotypic plasticity. Most strikingly, these isolates contain highly variable mini-chromosomes, which can contribute to the emergence of new pathogen variants. Intriguingly, phenotypic variation is prevalent in the field but phenotypes remain stable during subculturing, suggesting increased genome plasticity during this process. However, the extent of genomic structural variation in local populations and the underlying mechanisms, particularly somatic interchromosomal recombination, remains limited.
The aim of this project is to determine the molecular and regulatory mechanisms underlying genome dynamics and the phenotypic outcomes of structural genomic variation. Using two complementary and multidisciplinary approaches, that combine population genomics, experimental evolution, computational biology and molecular genetic techniques, I will investigate how environmental conditions and developmental cues influence the emergence of structural genomic variants and their phenotypic consequences. In addition, I will determine the impact of interchromosomal recombination events between mini-chromosomes and core chromosomes on local mutation rates, establishing if non-allelic recombination between core and mini-chromosomes contribute to local mutation rate biases affecting virulence effector gene divergence.
Collectively, the results from DYNAGEN will advance our understanding of the molecular mechanisms underlying structural genomic variation in fungal plant pathogens. This knowledge could be used to guide surveillance of emerging pathogen variants and develop crop disease prevention strategies.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2025-PF

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

MARTIN-LUTHER-UNIVERSITAT HALLE-WITTENBERG
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 202 125,12
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato
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