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CORDIS - Risultati della ricerca dell’UE
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Nanopore based evaluation of genomic, epigenetic and transcriptomic impact of gene editing

Obiettivo

Genome editing technologies such as CRISPR/Cas9 have transformed biomedical research and hold great therapeutic promise. Current safety evaluation strategies focus primarily on genomic alterations—off-target mutations, large deletions, and chromosomal rearrangements while largely overlooking transcriptomic and epigenomic consequences. Moreover, safety profiling is fragmented across multiple platforms, limiting accessibility and routine implementation.
This project, nanoGET, will establish a comprehensive, single-platform pipeline for safety evaluation of genome editing using nanopore sequencing which uniquely enables long-read sequencing of both DNA and RNA while simultaneously detecting base modifications, allowing integrated analysis of genomic, transcriptomic, and epigenetic changes within a single workflow. The pipeline will benchmark ONT against gold-standard methods for off-target detection, large deletions, DNA methylation profiling, chromatin accessibility, and transcriptomics. Using human iPSCs, the project will systematically evaluate the consequences of editing across the three layers. A key innovation is the direct comparison of double-strand break (DSB)-mediated editors (Cas9) with DSB-free approaches (base and prime editors), generating the first integrated dataset to quantify multi-layered differences between editing modalities.
By delivering an affordable, scalable, and standardized pipeline, nanoGET will provide novel insights into unintended consequences of editing, enable rational selection of editing methods, and accelerate the development of safer therapeutic strategies. Beyond research impact, this platform will expand access to high-quality safety evaluation worldwide, strengthening scientific progress, innovation, and public trust in genome editing.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2025-PF

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 247 553,28
Indirizzo
NORREGADE 10
1165 KOBENHAVN
Danimarca

Mostra sulla mappa

Regione
Danmark Hovedstaden Byen København
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato
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