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Physics-Informed Neural Networks for Accurate Computational Learning of RNA Elements

Ziel

Ribonucleic acid (RNA) molecules are central to cellular function and disease, with their biological roles being intrinsically linked to their complex three-dimensional (3D) structures. However, a significant gap exists between the number of known RNA sequences and experimentally determined structures. This data scarcity severely hampers the application of state-of-the-art deep learning methods, which have revolutionized protein structure prediction but fail to generalize for RNA due to their reliance on vast datasets.

The PINNACLE (Physics-Informed Neural Networks for Accurate Computational Learning of RNA Elements) project will address this fundamental challenge through a novel, physics-aware computational framework. The project has two primary objectives: 1) To construct and disseminate a high-quality, FAIR-compliant, and systematically curated dataset of RNA 3D structures, augmented with molecular simulations to capture molecular flexibility and rare interactions. 2) To develop and validate a novel Bayesian Physics-Informed Neural Network (B-PINN) that directly embeds the fundamental physical and biochemical laws governing RNA folding (e.g. electrostatics, base-stacking, torsional constraints) into the model's learning process.

PINNACLE will reduce the dependency on large training sets, improve generalization to novel RNA families, and provide robust uncertainty quantification for its predictions - a critical feature for guiding experimental research. This action will deliver a transformative open-source tool for the scientific community, accelerating research in RNA biology and the development of RNA-based therapeutics. Furthermore, this interdisciplinary training will equip the researcher with a unique skill-set at the intersection of AI, biophysics, and bioinformatics, providing a robust foundation for a future independent research career.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
Die Klassifikation dieses Projekts wurde von Menschen validiert.

Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2025-PF

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 263 393,28
Adresse
NORREGADE 10
1165 KOBENHAVN
Dänemark

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Region
Danmark Hovedstaden Byen København
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten

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