Ziel
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics have revolutionized biomedical research by deepening our understanding of gene expression profiles and cellular heterogeneity underlying development, tissue homeostasis, and disease. However, true longitudinal -omics approaches where temporal information is encoded in the same subject rather than inferred via cross-sectional sampling are still scarce; most available approaches based on metabolic labeling essentially collapse dynamics in two timepoints and cannot capture extended trajectories. Furthermore, spatial -omics methods encoding temporal information are largely missing. To fill this gap, I propose the development of BIO-CACHE: a generalizable, genetically encoded ‘nano-storage platform’–a ‘flight recorder’ for cells–enabling ‘subject locked’, temporally-resolved -omics. BIO-CACHE can be deployed at user defined time points to capture and store biomolecular snapshots of interest. Timestamped molecular states stored within BIO-CACHE can be later retrieved and temporally resolved to reconstruct chronological trajectories of the underlying biological events. To build BIO-CACHE, we will leverage bio-orthogonal capsid scaffolds, which will be functionalized with internal capture domains for RNA or proteins, and outward-facing, self-labelling protein tags enabling fluorescent time-stamping via brief ligand pulses. We will implement bulk and imaging-based spatial readouts for BIO-CACHE and connect with microwell-based single-cell workflows, enabling spatiotemporally-resolved molecular profiling across biological scales. BIO-CACHE fills a critical methodological gap by recording many timepoints over days in the same subject for true 4D-omics without cross-sectional confounds. By augmenting existing -omics with a temporal axis, BIO-CACHE will unlock unprecedented insights into cellular dynamics, advancing our ability to decipher complex biological systems and paving new avenues for therapeutic breakthroughs.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik RNS Transkriptome
- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Grundlagenmedizin Physiologie Homöostase
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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(öffnet in neuem Fenster) ERC-2026-STG
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
80333 Muenchen
Deutschland
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.