Objectif
The overall aim of the fellowship is to analyse the molecular evolution of a family of genes in fungi, which cause powdery mildew diseases of plants. Avirulence genes elicit host defences in gene-for-gene interactions with plants. The family to be studied is related to the Avrk1 gene in the barley mildew, Blumeria graminis f.sp. hordei.
The specific objectives are:
1. To research the evolution of members of the Avrk1-like gene family in diverse isolates of B. graminis hordei. This will identify elements of the genes, which are:
(a) conserved and may be required for pathogenicity,
(b) subject to diversifying selection, so probably involved in gene-for-gene interactions,
(c) not essential for pathogenicity. The work will involve culturing of B. graminis isolate s, cloning Avrk1-like fragments by homology with Avrk1, and sequencing of Avrk1-like genes, followed by phylogenetic analysis of sequences.
2. To examine host-specialisation of wheat and barley mildew by investigating the divergence of members of the Avrk1 -like family, and to research the distribution of Avrk1-like genes in diverse mildew pathogens of dicot plants. The methods used will be similar to those in Objective 1.
3. To analyse the association of Avrk1-like genes with avirulences, to identify Avrk1-like sequences as candidate avirulence genes. This will involve crossing B. graminis isolates, extracting ascospore progeny, and analysis of avirulence on a differential set of barley varieties. Avrk1 homologues will be analysed for sequence variation between the parents of the cross and polymorphisms mapped in the progeny to investigate their linkage to avirulence loci.
The fellowship will provide Ms Sacristan with expert training in:
1. Phylogenetic methods applied to evolution of DNA sequences (Objective s 1 and 2);
2. Fungal genetics and genetic analysis (Objective 3);
3. Advanced methods of molecular marker analysis (Objectives 1 and 3);
4. Fungal plant pathology and mycological methods (all 3 Objectives).
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie mycologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
- sciences naturelles sciences biologiques biologie moléculaire évolution moléculaire
- sciences agricoles agriculture, sylviculture et pêche agriculture céréales et oléagineux céréales
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP6-2002-MOBILITY-5
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
NORWICH
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.