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Contenuto archiviato il 2024-05-29

Evolution of elicitor (avirulence) genes in powdery mildew fungi (Diversity and evolution of avirulence in powdery mildews)

Obiettivo

The overall aim of the fellowship is to analyse the molecular evolution of a family of genes in fungi, which cause powdery mildew diseases of plants. Avirulence genes elicit host defences in gene-for-gene interactions with plants. The family to be studied is related to the Avrk1 gene in the barley mildew, Blumeria graminis f.sp. hordei.

The specific objectives are:
1. To research the evolution of members of the Avrk1-like gene family in diverse isolates of B. graminis hordei. This will identify elements of the genes, which are:
(a) conserved and may be required for pathogenicity,
(b) subject to diversifying selection, so probably involved in gene-for-gene interactions,
(c) not essential for pathogenicity. The work will involve culturing of B. graminis isolate s, cloning Avrk1-like fragments by homology with Avrk1, and sequencing of Avrk1-like genes, followed by phylogenetic analysis of sequences.

2. To examine host-specialisation of wheat and barley mildew by investigating the divergence of members of the Avrk1 -like family, and to research the distribution of Avrk1-like genes in diverse mildew pathogens of dicot plants. The methods used will be similar to those in Objective 1.

3. To analyse the association of Avrk1-like genes with avirulences, to identify Avrk1-like sequences as candidate avirulence genes. This will involve crossing B. graminis isolates, extracting ascospore progeny, and analysis of avirulence on a differential set of barley varieties. Avrk1 homologues will be analysed for sequence variation between the parents of the cross and polymorphisms mapped in the progeny to investigate their linkage to avirulence loci.

The fellowship will provide Ms Sacristan with expert training in:
1. Phylogenetic methods applied to evolution of DNA sequences (Objective s 1 and 2);
2. Fungal genetics and genetic analysis (Objective 3);
3. Advanced methods of molecular marker analysis (Objectives 1 and 3);
4. Fungal plant pathology and mycological methods (all 3 Objectives).

Campo scientifico (EuroSciVoc)

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP6-2002-MOBILITY-5
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

EIF - Marie Curie actions-Intra-European Fellowships

Coordinatore

JOHN INNES CENTRE
Contributo UE
Nessun dato
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato
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