Objectif
We concur to the IMI on “Reclassification of SLE, connective tissue diseases and RA” call by presenting a proposal aimed at using the power of OMICs, and bioinformatics to identify new classifications for diseases known to share common pathophysiological mechanisms. Such knowledge has not been applied to individual patients, depriving them from potential benefits in terms of the use of new therapeutic agents that are being developed for one disease but cannot be applied in another due to current clinical classifications.
We will investigate individuals with systemic lupus erythematosus (SLE), systemic sclerosis (SSc), Sjögren’s syndrome (Sjs), rheumatoid arthritis (RA), primary antiphospholipid syndrome (PAPS) and mixed connective tissue disease (MCTD), jointly as systemic autoimmune diseases (SADs). We believe that there will be overlapping clusters of individuals across diseases that will share molecular features. To determine these clusters we will, study 2000 cases of SADs, and 600 healthy controls to identify molecular clusters and their cellular and clinical correlates. In addition, we will study kidney and skin biopsies to define the development of molecular markers with severe kidney disease or with skin fibrosis. In this way we will define systemic and tissue taxonomies. We will study complete as well as isolated peripheral blood mononuclear cells and subpopulations and in biopsies gene expression and epigenetic marks with a combination of array and next generation sequencing (NGS) strategies. These studies will define cellular counts and proportions and changes in gene expression related to specific cellular populations. We will also use NGS strategies to define the presence of risk alleles (HLA and non-HLA) in all individuals. The data will be complemented with the study of the presence of autoantibodies in serum (analyzed in a reference lab), and we will use metabolomics mass spectrometry and NMR approaches to analyze plasma and urine metabolites. We will also study exosomes in plasma and urine and identify their molecular profiles. Samples will be collected following strict protocols and appropriate patient selection. The bioinformatics and biostatistics approaches will be aimed at the analysis of clusters with unsupervised clustering algorithms and tools and cross-validation. We will also perform analyses to determine risk and predictive models analyzing the genetic and molecular data at different levels, leading to a highly productive study with two arms, one for basic research and one with clinical applications. Among the clinical applications we will have a new classification for groups of patients sharing molecular mechanisms of disease, biomarkers for disease progression and organ damage prediction, and we will develop assays that can be easily applied in the clinic. The resultant clinically applicable clusters will be then validated in a longitudinal, inception trial where newly recruited patients will be analyzed at baseline and at two different time points and define their clustering status or their evolution towards specific clusters.
We will gain completely novel information that will open new avenues of research and new possibilities of collaboration between the public Academy and the private Pharmaceutical sector by establishing the basis for new clinical trials with the potential to really benefit the patients.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences médicales et de la santé médecine clinique rhumatologie
- sciences naturelles sciences biologiques biologie cellulaire
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale immunologie maladies auto-immunes
- sciences naturelles sciences chimiques chimie analytique spectrométrie de masse
- sciences médicales et de la santé médecine clinique néphrologie maladies rénales
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
IMI-JU-08-2012
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
JTI-CP-IMI - Joint Technology Initiatives - Collaborative Project (IMI)
Coordinateur
1070 Bruxelles / Brussel
Belgique
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Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.
Participants (28)
41092 Sevilla
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28002 MADRID
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4099 001 Porto
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28006 MADRID
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20122 Milano
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08908 L'Hospitalet De Llobregat
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Santander
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08036 Barcelona
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171 77 STOCKHOLM
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3000 LEUVEN
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50937 Koeln
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30625 Hannover
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1090 WIEN
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1228 Plan-les-Ouates
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41071 SEVILLA
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2371 AGIOS DOMETIOS
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18071 GRANADA
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20122 Milano
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1348 LOUVAIN LA NEUVE
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29200 BREST
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1211 Geneve
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6720 Szeged
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Participation terminée
10117 Berlin
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51373 Leverkusen
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91190 GIF-SUR-YVETTE
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94250 Gentilly
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RG21 4FA BASINGSTOKE
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10117 Berlin
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