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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Contenido archivado el 2024-05-29

Structural basis and specificity of antigenic peptide trimming by the newly discoverd ER aminopeptidases ERAP1 and ERAP2

Objetivo

The recognition by cytotoxic lymphocytes of antigenic peptides presented by MHC class I molecules plays a crucial role in cellular defences against viruses and cancer. MHC class I molecules present peptides that are 8-9 residues long and are derived from p eptides generated during degradation of proteins by the proteasome. However, proteasomes generally release longer precursors to the presented epitopes. These precursors are trimmed further in the Endoplasmic Reticulum (ER) by the recently discovered aminop eptidases, ERAP1 and probably also ERAP2. Over-expression or depletion of ERAP1 has strong effects on the presentation of peptide epitopes in vivo. This enzyme has the novel property of trimming N-extended precursors to peptides of 8 or 9 residues, the siz e required for loading onto MHC class I molecules, and then stopping. A highly homologous aminopeptidase LRAP (ERAP2) is also find in the ER although its antigenic peptide trimming properties are still obscure. Unlike typical aminopeptidases, ERAP1 display s specificity for amino acids located away from the N-terminus of the peptide, raising the interesting possibility that its specificity correlates with the binding preferences of MHC-Class II molecules. Because of their importance in immunology and very un usual biochemical properties, greater information about their biochemical features is of major scientific and medical interest. To gain insights to the mechanism and specificity of these enzymes, I propose to solve the three dimensional structure of ERAP1 and ERAP2 by x-ray crystallography and to further characterize their peptide trimming specificity by enzymatic and biophysical methods. Such studies should help us understand the molecular basis of their unique properties and obtain insights on their spe cific roles in determining the nature of the antigens presented.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

FP6-2002-MOBILITY-12
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Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

IRG - Marie Curie actions-International re-integration grants

Coordinador

NATIONAL CENTER FOR SCIENTIFIC RESEARCH DEMOKRITOS
Aportación de la UE
Sin datos
Dirección
Institute of Radioisotopes & Radiodiagnostic ProductsNCSR Demokritos
AGHIA PARASKEVI
Grecia

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Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

Sin datos
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