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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-05-29

Structural basis and specificity of antigenic peptide trimming by the newly discoverd ER aminopeptidases ERAP1 and ERAP2

Objectif

The recognition by cytotoxic lymphocytes of antigenic peptides presented by MHC class I molecules plays a crucial role in cellular defences against viruses and cancer. MHC class I molecules present peptides that are 8-9 residues long and are derived from p eptides generated during degradation of proteins by the proteasome. However, proteasomes generally release longer precursors to the presented epitopes. These precursors are trimmed further in the Endoplasmic Reticulum (ER) by the recently discovered aminop eptidases, ERAP1 and probably also ERAP2. Over-expression or depletion of ERAP1 has strong effects on the presentation of peptide epitopes in vivo. This enzyme has the novel property of trimming N-extended precursors to peptides of 8 or 9 residues, the siz e required for loading onto MHC class I molecules, and then stopping. A highly homologous aminopeptidase LRAP (ERAP2) is also find in the ER although its antigenic peptide trimming properties are still obscure. Unlike typical aminopeptidases, ERAP1 display s specificity for amino acids located away from the N-terminus of the peptide, raising the interesting possibility that its specificity correlates with the binding preferences of MHC-Class II molecules. Because of their importance in immunology and very un usual biochemical properties, greater information about their biochemical features is of major scientific and medical interest. To gain insights to the mechanism and specificity of these enzymes, I propose to solve the three dimensional structure of ERAP1 and ERAP2 by x-ray crystallography and to further characterize their peptide trimming specificity by enzymatic and biophysical methods. Such studies should help us understand the molecular basis of their unique properties and obtain insights on their spe cific roles in determining the nature of the antigens presented.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

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Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP6-2002-MOBILITY-12
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Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

IRG - Marie Curie actions-International re-integration grants

Coordinateur

NATIONAL CENTER FOR SCIENTIFIC RESEARCH DEMOKRITOS
Contribution de l’UE
Aucune donnée
Adresse
Institute of Radioisotopes & Radiodiagnostic ProductsNCSR Demokritos
AGHIA PARASKEVI
Grèce

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Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

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