Objectif
The aim of this proposal is to develop novel computational tools that extend the scope of NMR spectroscopy and make possible functional and structural studies of larger proteins and biomolecular complexes. In particular, the aim is to develop a software pa ckage that will facilitate programmes in functional and structural genomics, i.e.: (1) The identification of interaction sites with other proteins, ligands and drugs; studies of the conformations of excited states; and studies of molecular dynamics. (2) S tructure determination of larger proteins and biomolecular complexes that are not amenable to crystallisation. This project will involve: (1) The development of novel computational tools that allow rapid assignment of NMR spectra for studies of biomolecu lar interactions and dynamics by making optimal use of existing (in particular structural) information, i.e. the NMR equivalent of molecular replacement in X-ray crystallography. (2) Extending the scope of NMR spectroscopy by developing novel tools that al low the calculation of structures without the need for prior spectral assignment. (3) The development of improved tools for the identification and quantification of signals from NMR data. These key scientific objectives will be facilitated by the developm ent and implementation of a series of computational algorithms involving Bayesian analysis, maximum entropy reconstruction, multi-dimensional decomposition , principle component analysis, and statistical- and expert system based analysis tools. These algor ithms will be implemented within a common software framework developed by the CCPN project, so that they can be flexibly employed in the development of the different tools. We will develop novel tools for the validation of structures and experimental resul ts and mine databases for NMR and structural information crucial to the aims of the project.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences de la Terre et sciences connexes de l'environnement géologie minéralogie cristallographie
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP6-2004-LIFESCIHEALTH-5
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
CAMBRIDGE
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.