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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-05-29

Approaching atomic resolution in structures of macromolecular assemblies by combining X-ray diffraction and electron microscopy : Methodological developments and application to SIRV1 virus

Objectif

X-ray crystallography (XR) provides atomic resolution models of subunits of large biological assemblies, while electron microscopy (EM) allows lower-resolution imaging of whole macromolecular complexes. Combining the information from both techniques by fitting an atomic XR model into an EM density map enables in principle atomic-level interpretation of the EM data. We propose first to develop graphical software for manually fitting atomic XR models into EM data while simultaneously calculating the correlation between the models and the data using a fast reciprocal-space method [Navaza et al., Acta Crys. D58 (2002), 1820].

Second, we plan to implement an automatic fitting procedure with a complete 6-dimensional (3 rotations and 3 translations) search, based on a recently developed 6D extension of the fast rotational matching technique [Kovacs et al., Acta Crys. D59 (2003), 1371]. As a complement to these methodological developments, we will study using EM the structure of SIRV1, a rudivirus infecting thermophilic Archaea [Prangishvili et al., Genetics 152 (1999), 1387]. We will then use our newly developed software to fit the structures of viral proteins into the EM reconstruction.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP6-2004-MOBILITY-12
Voir d’autres projets de cet appel

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

EIF - Marie Curie actions-Intra-European Fellowships

Coordinateur

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE
Contribution de l’UE
Aucune donnée
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée
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