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Contenuto archiviato il 2024-05-29

Approaching atomic resolution in structures of macromolecular assemblies by combining X-ray diffraction and electron microscopy : Methodological developments and application to SIRV1 virus

Obiettivo

X-ray crystallography (XR) provides atomic resolution models of subunits of large biological assemblies, while electron microscopy (EM) allows lower-resolution imaging of whole macromolecular complexes. Combining the information from both techniques by fitting an atomic XR model into an EM density map enables in principle atomic-level interpretation of the EM data. We propose first to develop graphical software for manually fitting atomic XR models into EM data while simultaneously calculating the correlation between the models and the data using a fast reciprocal-space method [Navaza et al., Acta Crys. D58 (2002), 1820].

Second, we plan to implement an automatic fitting procedure with a complete 6-dimensional (3 rotations and 3 translations) search, based on a recently developed 6D extension of the fast rotational matching technique [Kovacs et al., Acta Crys. D59 (2003), 1371]. As a complement to these methodological developments, we will study using EM the structure of SIRV1, a rudivirus infecting thermophilic Archaea [Prangishvili et al., Genetics 152 (1999), 1387]. We will then use our newly developed software to fit the structures of viral proteins into the EM reconstruction.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP6-2004-MOBILITY-12
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

EIF - Marie Curie actions-Intra-European Fellowships

Coordinatore

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE
Contributo UE
Nessun dato
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato
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