Objectif
Natural genetic variation within populations largely determines phenotypic variation and is increasingly recognized as a critical factor in such diverse contexts as crop productivity or human disease susceptibility. For instance, diseases can be considered as quantitative traits, with disease occurring beyond a certain boundary along a spectrum. Whether a given allele confers a disease burden can depend on environmental factors, but also on the presence of particular alleles at other loci. Thus, natural allelic variants that by themselves are a priori not deleterious can have strong synthetic effects when combined. In the extreme, such genetic interactions can lead to hybrid sterility or breakdown, processes which are thought to drive reproductive isolation and thus initiate speciation. Despite their importance, the extent and nature of such natural genetic interactions in multicellular eukaryotes remains largely unknown. Here, we use the model plant Arabidopsis thaliana to study two cases of genetic incompatibility, leading to synthetic infertility and lethality, respectively. These phenotypes were recovered by chance in crosses between hy5 hyh double mutants and the brx mutant and result from complex, background-dependent genetic interactions. Importantly, the high frequency of the novel phenotypes suggests that they do not represent double or triple mutants between the hy5, hyh or brx loci. Rather, initial genetic mapping indicates that the phenotypes are due to genetic interactions involving two wild type background-specific alleles at novel loci. The primary aim of the proposed research is to isolate these alleles by map-based cloning and use this information to decipher the molecular genetic basis of the observed phenotypes. We expect that this work will establish a rare example of deleterious genetic interactions involving naturally occurring alleles, which will be conceptually highly relevant for the field of Genetics as a whole.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/fr/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique
- sciences sociales économie et affaires économie économie de la production productivité
- sciences agricoles agriculture, sylviculture et pêche agriculture
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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FP7-PEOPLE-2007-2-1-IEF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
1015 LAUSANNE
Suisse
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.