Objetivo
A complex network of transcription factor interactions controls the process by which B lymphocytes develop from hematopoietic stem cells (HSCs). Pax5 has been identified as the critical transcription factor controlling B cell commitment throughout B lymphopoiesis. These analyses revealed that Pax5 commits early hematopoietic progenitors to the B cell pathway by repressing B-lineage-inappropriate genes and by simultaneously activating B-cell-specific genes. By comprehensive cDNA microarray analysis, 110 Pax5-repressed and 170 Pax5-activated genes have been identified, demonstrating that Pax5 controls a complex regulatory network involved in B cell signaling, adhesion, migration and immune function. The goal of the project proposed here will be to systematically analyze all direct Pax5 target genes in the entire genome during B cell development. Recently, a mouse strain carrying a biotin tag at the C-terminus of Pax5 has been generated. We will use this mouse strain for genome-wide identification of Pax5-binding sites by chromatin precipitation and Solexa 1G ultrahigh-throughput DNA sequencing. Islands of chromatin modifications have been shown to provide an efficient way of identifying active and repressed promoters and cis-regulatory elements. Here we propose to use chromatin immunoprecipitation (ChIP)-sequencing to map the entire mouse genome for Pax5-controlled promoters and cis-regulatory elements. Integration of this information with the identification of Pax5-binding sites will provide us with a genome-wide map of functional Pax5-binding sites, from which a list of all direct target genes of Pax5 during B cell development will be obtained. The project proposed here will constitute an essential piece of a larger group effort, which aims at elucidating the gene regulatory network interactions controlling B cell development.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas biología celular comunicación celular
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
FP7-PEOPLE-2007-2-1-IEF
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Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
1030 Wien
Austria
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.