Obiettivo
A complex network of transcription factor interactions controls the process by which B lymphocytes develop from hematopoietic stem cells (HSCs). Pax5 has been identified as the critical transcription factor controlling B cell commitment throughout B lymphopoiesis. These analyses revealed that Pax5 commits early hematopoietic progenitors to the B cell pathway by repressing B-lineage-inappropriate genes and by simultaneously activating B-cell-specific genes. By comprehensive cDNA microarray analysis, 110 Pax5-repressed and 170 Pax5-activated genes have been identified, demonstrating that Pax5 controls a complex regulatory network involved in B cell signaling, adhesion, migration and immune function. The goal of the project proposed here will be to systematically analyze all direct Pax5 target genes in the entire genome during B cell development. Recently, a mouse strain carrying a biotin tag at the C-terminus of Pax5 has been generated. We will use this mouse strain for genome-wide identification of Pax5-binding sites by chromatin precipitation and Solexa 1G ultrahigh-throughput DNA sequencing. Islands of chromatin modifications have been shown to provide an efficient way of identifying active and repressed promoters and cis-regulatory elements. Here we propose to use chromatin immunoprecipitation (ChIP)-sequencing to map the entire mouse genome for Pax5-controlled promoters and cis-regulatory elements. Integration of this information with the identification of Pax5-binding sites will provide us with a genome-wide map of functional Pax5-binding sites, from which a list of all direct target genes of Pax5 during B cell development will be obtained. The project proposed here will constitute an essential piece of a larger group effort, which aims at elucidating the gene regulatory network interactions controlling B cell development.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali scienze biologiche biologia cellulare segnalazione cellulare
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
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- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP7-PEOPLE-2007-2-1-IEF
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
1030 Wien
Austria
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.