Objectif
A complex network of transcription factor interactions controls the process by which B lymphocytes develop from hematopoietic stem cells (HSCs). Pax5 has been identified as the critical transcription factor controlling B cell commitment throughout B lymphopoiesis. These analyses revealed that Pax5 commits early hematopoietic progenitors to the B cell pathway by repressing B-lineage-inappropriate genes and by simultaneously activating B-cell-specific genes. By comprehensive cDNA microarray analysis, 110 Pax5-repressed and 170 Pax5-activated genes have been identified, demonstrating that Pax5 controls a complex regulatory network involved in B cell signaling, adhesion, migration and immune function. The goal of the project proposed here will be to systematically analyze all direct Pax5 target genes in the entire genome during B cell development. Recently, a mouse strain carrying a biotin tag at the C-terminus of Pax5 has been generated. We will use this mouse strain for genome-wide identification of Pax5-binding sites by chromatin precipitation and Solexa 1G ultrahigh-throughput DNA sequencing. Islands of chromatin modifications have been shown to provide an efficient way of identifying active and repressed promoters and cis-regulatory elements. Here we propose to use chromatin immunoprecipitation (ChIP)-sequencing to map the entire mouse genome for Pax5-controlled promoters and cis-regulatory elements. Integration of this information with the identification of Pax5-binding sites will provide us with a genome-wide map of functional Pax5-binding sites, from which a list of all direct target genes of Pax5 during B cell development will be obtained. The project proposed here will constitute an essential piece of a larger group effort, which aims at elucidating the gene regulatory network interactions controlling B cell development.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biologie cellulaire signalisation cellulaire
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences médicales et de la santé biotechnologie médicale technologies cellulaires cellule souche
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2007-2-1-IEF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
1030 Wien
Autriche
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.