Ziel
The aim of this grant is to understand the relationships between genomic topology and the control of transcription, using the HoxD locus as a paradigm. We will take a system approach in the mouse, combining tools of genetics, evolutionary genomics and biochemistry to try and model various modes of large-scale gene regulations occurring during development. The results will tell us about the mechanistic bases of global gene regulation and how such regulations evolved, by integrating these mechanisms into the evolutionnary contexts of the respective structures. The approach will make use of our unique collection of mutants at this locus along with both transcript profiling and quantitation, ChIP of several proteins (modifications thereof-) indicative of chromatin states, chromosome conformation capture (4C) and transgenesis after phylogenetic footprint. To keep datasets within reasonable scales and allow for their integration into a single model structures, we will focus on a 2 Mb large DNA interval centered around the HoxD locus, which contains range of conserved non-coding DNA sequences and includes a gene-rich island, flanked by two large gene-deserts bordered again by gene-rich regions. We will conduct systematic analyses of these multiple parameters in various embryonic tissues, at different times where and when Hox genes are required. The massive datasets generated (ca 15 different points for transcript quantification, profiling, chromatin modifications, 4C, from ca 10 different tissues at 3 developmental times, from as many as 20 mutant strains) will feed mechanistic models accounting for the modalities of these regulations. Models will be compared to one another to try and reconstitute the evolution of these regulations. Such a combination of genetics, biochemistry and modeling, carried out on a locus where global gene function is already well worked out, will give us a comprehensive view of the underlying regulatory mechanisms, with a high heuristic value
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik DNS
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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ERC-2008-AdG
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Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Gastgebende Einrichtung
1015 LAUSANNE
Schweiz
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.