Objectif
Viruses are simple, obligatory, intracellular parasites that depend on the host cell for most of the steps in the replication cycle. Not only do they rely on the cells biosynthetic machinery, they exploit cellular processes for signaling, membrane trafficking, intra-cellular transport, nuclear import and export, molecular sorting, transcriptional regulation, etc. To access the full spectrum of host cell functions in the infection of three different viruses in an unbiased and systematic fashion, we will identify the critical host cell proteins needed by monitoring infection in human tissue culture cells after silencing individual genes using genome-wide siRNA libraries and large sub-libraries based on the human genome. The three viruses are vaccinia virus (a poxvirus), human papilloma virus 16, and Uukuniemi virus (a bunyavirus). They are members of important but poorly analyzed pathogen families representing enveloped and nonenveloped viruses, RNA and DNA viruses, viruses that replicate in the nucleus and in the cytosol. The infection assays to be used are fully automated, and make use of high-content microscopic read-outs for infection and virus production. Identification of the viral infectomes , in this way, offers a valuable, new perspective into the complexities of the infection process, and opens wide new areas of basic and applied research. After validation of hits , extensive biochemical and cell biological analysis will be performed on a selected set of host proteins and pathways identified through the infectome analysis. We will determine which steps in the replication cycle are affected, which mechanisms are involved, and which cellular pathways play a role. For detailed analysis, we will focus on mechanisms in entry, uncoating, and early intracellular events. A large spectrum of techniques including live cell imaging and single particle tracking will be used to follow up the screening results with functional and mechanistic studies.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie virologie
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences médicales et de la santé sciences de la santé maladie infectieuse virus à ADN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
ERC-2008-AdG
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Institution d’accueil
8092 Zuerich
Suisse
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.