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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-06-18

Dissecting the fluorescence properties of the Enhanced Cyan Fluorescent Protein by computational analysis of its structure and dynamics

Objectif

Due to its intrinsic visible fluorescence, the Green Fluorescent Protein (GFP) is used to monitor cellular and biomolecular functions. Its chromophore is formed by cyclization of three aminoacid residues: Ser65, Tyr66 and Gly67. The substitution of Tyr66 b y Trp and few additional mutations lead to the Enhanced Cyan Fluorescent Protein (ECFP), characterized by cyan emission.

One unexplained feature is that ECFP has double humped rather than conventional single excitation and emission peaks. NMR and crystallo-graphic studies suggested that these two spectral peaks of ECFP originate from two conformational states of the protein. However, a preliminary time-resolved fluorescence study indicates that the photophysics of ECFP is more complicated. At least four lifetimes, which depend differently on pH and temperature are required to describe the fluorescence decay and suggest more than two fluorescent species.

Molecular calculations and simulations are particularly valuable for relating properties of biomolecules t o their structure. Our project will be the first study which will combine a variety of theoretical techniques and relate the results to spectral data, in order to understand the intriguing photophysics of ECFP. From electrostatic calculations we will obtain the population probabilities of the different states as a function of pH.

The analysis of molecular dynamics and of quantum mechanical calculations will provide information on the behaviour of each state and the temperature dependence of this behaviour. T he combination of these two approaches, together with the results of the excited state dynamics analysis, will lead to a quantitative mechanistic model of the dependence of the fluorescence signal on pH and temperature.

Understanding the structural basis o f the photophysical process will lead to the design of ECFP mutants with simplified or modified photophysical properties improving the fluorescence tools for cellular biology and medical diagnostics.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP6-2004-MOBILITY-5
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Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

EIF - Marie Curie actions-Intra-European Fellowships

Coordinateur

UNIVERSITAET BAYREUTH
Contribution de l’UE
Aucune donnée
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée
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