Skip to main content
Weiter zur Homepage der Europäischen Kommission (öffnet in neuem Fenster)
Deutsch Deutsch
CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
CORDIS
Inhalt archiviert am 2024-06-18

Dissecting the fluorescence properties of the Enhanced Cyan Fluorescent Protein by computational analysis of its structure and dynamics

Ziel

Due to its intrinsic visible fluorescence, the Green Fluorescent Protein (GFP) is used to monitor cellular and biomolecular functions. Its chromophore is formed by cyclization of three aminoacid residues: Ser65, Tyr66 and Gly67. The substitution of Tyr66 b y Trp and few additional mutations lead to the Enhanced Cyan Fluorescent Protein (ECFP), characterized by cyan emission.

One unexplained feature is that ECFP has double humped rather than conventional single excitation and emission peaks. NMR and crystallo-graphic studies suggested that these two spectral peaks of ECFP originate from two conformational states of the protein. However, a preliminary time-resolved fluorescence study indicates that the photophysics of ECFP is more complicated. At least four lifetimes, which depend differently on pH and temperature are required to describe the fluorescence decay and suggest more than two fluorescent species.

Molecular calculations and simulations are particularly valuable for relating properties of biomolecules t o their structure. Our project will be the first study which will combine a variety of theoretical techniques and relate the results to spectral data, in order to understand the intriguing photophysics of ECFP. From electrostatic calculations we will obtain the population probabilities of the different states as a function of pH.

The analysis of molecular dynamics and of quantum mechanical calculations will provide information on the behaviour of each state and the temperature dependence of this behaviour. T he combination of these two approaches, together with the results of the excited state dynamics analysis, will lead to a quantitative mechanistic model of the dependence of the fluorescence signal on pH and temperature.

Understanding the structural basis o f the photophysical process will lead to the design of ECFP mutants with simplified or modified photophysical properties improving the fluorescence tools for cellular biology and medical diagnostics.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

Sie müssen sich anmelden oder registrieren, um diese Funktion zu nutzen

Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

FP6-2004-MOBILITY-5
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

EIF - Marie Curie actions-Intra-European Fellowships

Koordinator

UNIVERSITAET BAYREUTH
EU-Beitrag
Keine Daten
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten
Mein Booklet 0 0