Skip to main content
Vai all'homepage della Commissione europea (si apre in una nuova finestra)
italiano italiano
CORDIS - Risultati della ricerca dell’UE
CORDIS
Contenuto archiviato il 2024-06-18

Dissecting the fluorescence properties of the Enhanced Cyan Fluorescent Protein by computational analysis of its structure and dynamics

Obiettivo

Due to its intrinsic visible fluorescence, the Green Fluorescent Protein (GFP) is used to monitor cellular and biomolecular functions. Its chromophore is formed by cyclization of three aminoacid residues: Ser65, Tyr66 and Gly67. The substitution of Tyr66 b y Trp and few additional mutations lead to the Enhanced Cyan Fluorescent Protein (ECFP), characterized by cyan emission.

One unexplained feature is that ECFP has double humped rather than conventional single excitation and emission peaks. NMR and crystallo-graphic studies suggested that these two spectral peaks of ECFP originate from two conformational states of the protein. However, a preliminary time-resolved fluorescence study indicates that the photophysics of ECFP is more complicated. At least four lifetimes, which depend differently on pH and temperature are required to describe the fluorescence decay and suggest more than two fluorescent species.

Molecular calculations and simulations are particularly valuable for relating properties of biomolecules t o their structure. Our project will be the first study which will combine a variety of theoretical techniques and relate the results to spectral data, in order to understand the intriguing photophysics of ECFP. From electrostatic calculations we will obtain the population probabilities of the different states as a function of pH.

The analysis of molecular dynamics and of quantum mechanical calculations will provide information on the behaviour of each state and the temperature dependence of this behaviour. T he combination of these two approaches, together with the results of the excited state dynamics analysis, will lead to a quantitative mechanistic model of the dependence of the fluorescence signal on pH and temperature.

Understanding the structural basis o f the photophysical process will lead to the design of ECFP mutants with simplified or modified photophysical properties improving the fluorescence tools for cellular biology and medical diagnostics.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

È necessario effettuare l’accesso o registrarsi per utilizzare questa funzione

Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP6-2004-MOBILITY-5
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

EIF - Marie Curie actions-Intra-European Fellowships

Coordinatore

UNIVERSITAET BAYREUTH
Contributo UE
Nessun dato
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato
Il mio fascicolo 0 0