Objetivo
The recent discovery of a large number of low abundance bacterial phylotypes, coined the ‘rare biosphere’, coexisting next to a few abundant phylotypes raises a number of fundamental questions concerning their role in the microbial food web and their functioning in the biogeochemical cycles, mainly driven by prokaryotes in the ocean. HERA addresses some of these basic questions concerning the role of the ‘rare biosphere’ in coastal European waters using a set of different approaches and recent technological advances. The first approach is to use fractionation of the complex bacterial community by flow cytometry and high speed cell sorting and cell sorting by capillary electrophoresis, the latter based on the specific surface charge of bacteria. This fractionated community will then be subjected to PCR and two fingerprinting techniques, T-RFLP and ARISA. The other approach, to obtain more detailed information on the phylogeny of the ‘rare biosphere’ vs. abundant phylotypes is based on cell sorting of individual populations, enumerating their abundance and using highly multiple displacement amplification (MDA) and subsequently, cloning and sequencing. With this approach, the phylogeny and the abundance of the individual components of the ‘rare biosphere’ will be compared with that of the abundant phylotypes. Leucine incorporation in bacteria and subsequent fractionation will allow comparing the cell-specific growth rates of abundant vs. rare phylotypes. A similar approach is used to determine the phylotype-specific ectoenzymatic activity. Taken together, the combination of approaches will allow us answering some of the fundamental but unsolved questions on the role of the rare biosphere in the microbial food web and in the biogeochemical cycles in coastal seas. The study will be performed over a seasonal cycle hence, we will be able to resolve the enigma whether members of the ‘rare biosphere’ can attain high or low abundance shaping to the organic matter cycling.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas morfología biológica morfología comparativa
- ciencias naturales ciencias biológicas ecología
- ciencias naturales ciencias de la tierra y ciencias ambientales conexas ciencias de la atmósfera meteorología biosfera
- ciencias naturales ciencias químicas electroquímica electroforesis
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología bacteriología bacteriomas
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
FP7-PEOPLE-IEF-2008
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Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
1797 SZ DEN HOORN TEXEL
Países Bajos
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.